Director catalán, máximo exponente del cine de terror en España. Se licenció en la Universidad de Barcelona en Ciencias de la Comunicación. Estudió Fotografía y Dirección Cinematográfica y comenzó trabajando en radio y en una revista propia.

Durante los años 90 dirigió varios cortos: Alicia (1994), Premio al Mejor Cortometraje en el Festival de Cine de Sitges y Días sin luz (1995), Premio de la Audiencia en el Festival de Cine Fantástico de Suecia. Un año más tarde, realizó algunos episodios de la serie televisiva Nueva ficción (1996), en la que también participaron Jesús Mora, Jo Sol, Agustín Vila y Jesús Font.

En 1999 rueda su opera prima: Los sin nombre, una película de terror que cuenta la búsqueda desesperada por parte de una madre de su hija fallecida cinco años atrás. El filme fue galardonado con el Meliès de Oro en el Festival de Cine de Sitges, además de ser premiado en el Festival de Cine Fantástico de Bruselas.

Darkness (2002), su segundo largometraje de terror, está ambientado en una casa que esconde un pasado oscuro y un secreto inconfesable. En Estados Unidos fue la sexta película más vista esa temporada.

O.T: la película (2002), codirigida junto a Paco Plaza, tiene características del cine documental al mostrar los testimonios y conciertos de aquellos jóvenes de la primera temporada del show televisivo durante la gira veraniega de conciertos.

Frágiles (2005), otra película de suspense fue producida por Castelao Producciones y rodada en Barcelona e Inglaterra. Está protagonizada por la televisiva Allie McBeal, es decir, Calista Flockhart, quien interpreta a una enfermera que comienza a trabajar en el turno de noche en un hospital infantil británico que está a punto de ser cerrado. Su compañera de reparto es Elena Anaya. El filme obtuvo el Premio a la Mejor Música del Círculo de Escritores Cinematográficos y el Goya a los Mejores Efectos Especiales.

A comienzos de 2006, el director ilerdense estrenó una entrega de la serie de suspense titulada Películas para no dormir, emitida por Telecinco. El telefilme en formato cine que Balagueró dirigió se llama Para entrar a vivir (2006). En esta serie de suspense también participaron Mateo Gil, Paco Plaza, Enrique Urbizu, Álex de la Iglesia y Chicho Ibáñez Serrador.

Junto al director valenciano Paco Plaza, ha dirigido el filme de terror Rec (2007), con el que han recibido el Premio Goya al Mejor Montaje y el Premio a la Mejor Dirección en el Festival de Cine de Sitges (Barcelona). La historia del filme trata de una reportera de televisión (Manuela Velasco) que acompaña durante una noche a un equipo de bomberos, pero la primera intervención se convierte en una pesadilla.

La cinta, ganadora del Gran Premio en Fanstasporto y del Premio de la Audiencia en el Festival de Cine Fantástico de Ámsterdam, obtuvo un espectacular éxito taquillero el fin de semana de su estreno recaudando más de un millón y medio de euros y llevando a 263.000 espectadores a las salas de cine. Producida por Filmax, los autores de la película están ya trabajando en su secuela, además de haber vendido sus derechos para un remake norteamericano, Quarantined, dirigido por John Erick Dowdle y que se estrenará en otoño en Estados Unidos.